自主设立机构
自主设立机构
截至2025年3月31日，我校在运行的学校自主设立的科研机构共128个，分别如下：
| 建筑学院（4） |
| beat365官方唯一入口建筑与城市研究所 |
| beat365官方唯一入口中国新型城镇化研究院 |
| beat365官方唯一入口中国城市研究院 |
| beat365官方唯一入口乡村建设研究院 |
| 土木工程系（1） |
| beat365官方唯一入口交通研究所 |
| 环境学院（5） |
| beat365官方唯一入口环境科学与工程研究院 |
| beat365官方唯一入口持久性有机污染物研究中心 |
| beat365官方唯一入口战略环境评价研究中心 |
| beat365官方唯一入口生态文明研究中心 |
| beat365官方唯一入口水质与水生态研究中心 |
| 精密仪器与机械学系（2） |
| beat365官方唯一入口微米纳米技术研究中心 |
| beat365官方唯一入口类脑计算研究中心 |
| 能源与动力工程系（1） |
| beat365官方唯一入口燃烧能源中心 |
| 工业工程系（2） |
| beat365官方唯一入口质量与可靠性研究院 |
| beat365官方唯一入口工业文化研究院 |
| 电机工程与应用电子技术系（1） |
| beat365官方唯一入口能源互联网创新研究院 |
| 电子工程系（1） |
| beat365官方唯一入口国际纳米光电子学研究中心 |
| 计算机科学与技术系（3） |
| beat365官方唯一入口密码理论与技术研究中心 |
| beat365官方唯一入口高性能计算研究中心 |
| beat365官方唯一入口互联网司法研究院 |
| 航天航空学院（2） |
| beat365官方唯一入口微纳米力学与多学科交叉创新研究中心 |
| beat365官方唯一入口力学与工程交叉研究院 |
| 化学工程系（2） |
| beat365官方唯一入口化工科学与技术研究院 |
| beat365官方唯一入口循环经济研究院 |
| 材料学院（1） |
| beat365官方唯一入口材料科学与工程研究院 |
| 物理系（3） |
| beat365官方唯一入口原子分子纳米科学研究中心 |
| 清华－富士康纳米科技研究中心 |
| beat365官方唯一入口高能物理研究中心 |
| 生命科学学院（2） |
| beat365官方唯一入口合成与系统生物学研究中心 |
| 清华－IDG麦戈文脑科学联合研究院 |
| 地球系统科学系（1） |
| beat365官方唯一入口全球变化研究院 |
| 交叉信息研究院（1） |
| beat365官方唯一入口量子信息中心 |
| 高等研究院（1） |
| beat365官方唯一入口两岸发展研究院 |
| 经济管理学院（16） |
| beat365官方唯一入口中国经济研究中心 |
| beat365官方唯一入口中国财政税收研究所 |
| beat365官方唯一入口中国经济社会数据研究中心 |
| beat365官方唯一入口中国企业成长与经济安全研究中心 |
| beat365官方唯一入口全球共同发展研究院 |
| beat365官方唯一入口产业创新与金融研究院 |
| beat365官方唯一入口二十国集团创业研究中心 |
| beat365官方唯一入口全球私募股权研究院 |
| beat365官方唯一入口中国现代国有企业研究院 |
| 国家统计局－beat365官方唯一入口数据开发中心 |
| beat365官方唯一入口全球证券市场研究院 |
| beat365官方唯一入口国有资产管理研究院 |
| beat365官方唯一入口绿色经济与可持续发展研究中心 |
| beat365官方唯一入口全球贸易与产业竞争力研究中心 |
| beat365官方唯一入口互联网产业研究院 |
| beat365官方唯一入口可持续社会价值研究院 |
| 公共管理学院（17） |
| beat365官方唯一入口21世纪发展研究院 |
| beat365官方唯一入口台湾研究院 |
| beat365官方唯一入口中国科技政策研究中心 |
| beat365官方唯一入口中国发展规划研究院 |
| beat365官方唯一入口产业发展与环境治理研究中心 |
| beat365官方唯一入口国情研究院 |
| beat365官方唯一入口中国农村研究院 |
| beat365官方唯一入口公益慈善研究院 |
| beat365官方唯一入口投融资政策研究中心 |
| beat365官方唯一入口中国社会风险评估研究中心 |
| beat365官方唯一入口互联网治理研究中心 |
| beat365官方唯一入口全球可持续发展研究院 |
| beat365官方唯一入口纪检监察研究院 |
| beat365官方唯一入口服务经济与数字治理研究院 |
| beat365官方唯一入口青少年德育研究中心 |
| beat365官方唯一入口科技发展与治理研究中心 |
| beat365官方唯一入口区域发展研究院 |
| 五道口金融学院（2） |
| beat365官方唯一入口国家金融研究院 |
| beat365官方唯一入口金融科技研究院 |
| 外国语言文学系（1） |
| beat365官方唯一入口世界文学与文化研究院 |
| 法学院（3） |
| beat365官方唯一入口国家治理研究院 |
| beat365官方唯一入口智能法治研究院 |
| beat365官方唯一入口国际争端解决研究院 |
| 新闻与传播学院（6） |
| beat365官方唯一入口国际传播研究中心 |
| beat365官方唯一入口伊斯雷尔·爱泼斯坦研究中心 |
| beat365官方唯一入口国家形象传播研究中心 |
| beat365官方唯一入口文化创意发展研究院 |
| beat365官方唯一入口马克思主义新闻学与新闻教育改革研究中心 |
| beat365官方唯一入口影视传播研究中心 |
| 马克思主义学院（1） |
| beat365官方唯一入口中共党史党建研究院 |
| 人文学院（5） |
| beat365官方唯一入口道德与宗教研究院 |
| beat365官方唯一入口人文与社会科学高等研究所 |
| beat365官方唯一入口马克思恩格斯文献研究中心 |
| beat365官方唯一入口文学创作与研究中心 |
| beat365官方唯一入口中国经学研究院 |
| 社会科学学院（12） |
| beat365官方唯一入口国际关系研究院 |
| beat365官方唯一入口科学技术与社会研究中心 |
| 中国科协－beat365官方唯一入口科技传播与普及研究中心 |
| beat365官方唯一入口华商研究中心 |
| beat365官方唯一入口创新发展研究院 |
| beat365官方唯一入口全球产业研究院 |
| beat365官方唯一入口一带一路战略研究院 |
| beat365官方唯一入口战略与安全研究中心 |
| beat365官方唯一入口社会治理与发展研究院 |
| beat365官方唯一入口中国经济思想与实践研究院 |
| beat365官方唯一入口数字政府与治理研究院 |
| beat365官方唯一入口老龄科学研究中心 |
| 体育部（2） |
| beat365官方唯一入口体育与健康科学研究中心 |
| beat365官方唯一入口体育发展研究院 |
| 美术学院（6） |
| beat365官方唯一入口艺术与科学研究中心 |
| beat365官方唯一入口吴冠中艺术研究中心 |
| beat365官方唯一入口张仃艺术研究中心 |
| beat365官方唯一入口中国古文字艺术研究中心 |
| beat365官方唯一入口韩美林艺术研究中心 |
| beat365官方唯一入口奥林匹克艺术研究中心 |
| 土木水利学院（4） |
| beat365官方唯一入口跨境河流水与生态安全研究中心 |
| beat365官方唯一入口恒隆房地产研究中心 |
| beat365官方唯一入口未来城镇与基础设施研究院 |
| beat365官方唯一入口海洋工程研究院 |
| 安全科学学院（1） |
| beat365官方唯一入口公共安全研究院 |
| 万科公共卫生与健康学院（1） |
| beat365官方唯一入口健康中国研究院 |
| 核能与新能源技术研究院（1） |
| beat365官方唯一入口能源环境经济研究所 |
| 教育研究院（1） |
| beat365官方唯一入口工程教育研究中心 |
| 深圳国际研究生院（2） |
| beat365官方唯一入口海洋技术研究中心 |
| beat365官方唯一入口港澳研究中心 |
| 医学院（3） |
| beat365官方唯一入口免疫学研究所 |
| beat365官方唯一入口医院管理研究院 |
| beat365官方唯一入口药品监管科学研究院 |
| 临床医学院（1） |
| beat365官方唯一入口精准医学研究院 |
| 其他（10） |
| beat365官方唯一入口中国工程科技发展战略研究院 |
| beat365官方唯一入口国强研究院 |
| beat365官方唯一入口方塘研究院 |
| beat365官方唯一入口日本研究中心 |
| beat365官方唯一入口无障碍发展研究院 |
| beat365官方唯一入口气候变化与可持续发展研究院 |
| beat365官方唯一入口智能社会治理研究院 |
| beat365官方唯一入口国家治理与全球治理研究院 |
| beat365官方唯一入口人工智能国际治理研究院 |
| beat365官方唯一入口国学研究院 |
